İlkokulu Büyükbağlar Köyü İlkokulu’nda, orta ve lise eğitimini Tokat İmam-Hatip Lisesi’nde yüksek öğretimini İstanbul Üniversitesi Edebiyat Fakültesi Tarih Bölümü’nde 1987 yılında tamamladı. 1987 yılında Araştırma Görevlisi oldu. 1997 tarihinde savunarak Doktor unvanını aldı. 1999 tarihinde Yeniçağ Tarihi Anabilim Dalında Yrd. Doç. Kadrosuna atandı. 2005 tarihinde Yeniçağ ve Yakın Çağ Doçenti unvanını aldı. 2006 tarihinde Yeniçağ Tarihi Anabilim Dalı’nda Doçent kadrosuna atandı. 2011 tarihinde Yeniçağ Tarihi Anabilim Dalında Profesörlük kadrosuna atandı.Rektörü olarak, Vakıf Yükseköğretim Kurumları Yönetmeliği uyarınca Haliç Üniversitesi‘nin geçici Mütevelli Heyeti Başkanı olmuştur.
2 Nisan 2015 tarihinden itibaren İÜ Rektörü olarak görev yapmaktadır. Evli ve üç çocuk babasıdır. Fransızca ve Arapça bilmektedir.
ASAD Başkanı Murat Doğanay İstanbul Üniversitesi Rektörü Prof. Dr. Sayın Mahmut Ak Bey’e Türklüğün sembolü olan kızıl elma plaketini takdim etti.
